FeMSA fait officiellement partie de IFMSA-Morocco.
IFMSA-Morocco est une association apolitique nationale à but non lucratif, créée en Avril 2012. Elle compte dans ses rangs, plus de 2.000 étudiants en médecine venant de l’ensemble du Royaume et contribue à l’amélioration des connaissances et des capacités des étudiants en médecine à travers des formations, des conférences mais aussi l’organisation de projets promouvant la santé publique, les droits de l’homme, la paix, la santé sexuelle et reproductive, l’éducation médicale et contribuant ainsi à la formation des médecins de demain. La fédération marocaine fait partie du réseau mondial de IFMSA, International Federation of Medical Students’ Associations, organisme représentant les associations des étudiants en médecine dans plus de 135 organisations membres soit plus de 1,3 million d'étudiants représentés dans le monde entier.

Depuis plus de 60 ans, IFMSA est reconnue comme une organisation non gouvernementale au sein du système des Nations Unies et de l'Organisation mondiale de la santé (OMS) et a reçu une reconnaissance officielle de l'Association médicale mondiale (WMA).

IFMSA se définit comme une organisation non-gouvernementale, apolitique qui défend et encourage l’implication des futurs médecins dans l’élaboration des politiques nationales et internationales en matière de la santé ainsi que leur contribution à l’amélioration des indicateurs de cette dernière à travers des projets et des programmes variés qui s’inscrivent dans le cadre des 4 grands domaines suivants :

-La santé publique
-La santé sexuelle et reproductive
-L'éducation médicale
-Les droits de l’homme et de la paix

De plus, IFMSA organise le plus grand programme d’échange à gestion estudiantine au monde avec près de 13000 étudiants partant en échange pour un stage clinique ou de recherche par an.